Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PKMP1-201ENST00000455804 1523 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 VSTM1-202ENST00000366170 654 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AKIRIN1P2-201ENST00000440655 570 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC103876.1-203ENST00000565495 290 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms