Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 343.3 ms