Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCDC112Q8NEF3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCDC112Q8NEF3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCDC112Q8NEF3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCDC112Q8NEF3 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCDC112Q8NEF3 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC112Q8NEF3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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