Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SCG3Q8WXD2 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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