Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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