Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 TRAF3IP3-202ENST00000367024 2331 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 CFAP52-201ENST00000352665 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 ACSBG2-202ENST00000586696 2739 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 B3GALT5-204ENST00000398714 2341 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AL606970.1-201ENST00000445442 2559 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 PRPS2-202ENST00000380668 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 TATDN2P2-201ENST00000403590 2226 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AC104435.2-201ENST00000478745 866 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AC019294.1-202ENST00000566174 2071 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 GIMAP6-201ENST00000328902 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 DERL3-203ENST00000404056 3113 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 ALAS1-201ENST00000310271 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 ANKLE2-208ENST00000542282 3302 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 TSC22D3-206ENST00000372397 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 ASIC2-202ENST00000359872 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MYRIPQ8NFW9 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms