Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC003101.1-201ENST00000412403 459 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 GPAT2P2-201ENST00000445404 863 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC091057.1-201ENST00000501830 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AP003469.2-201ENST00000524369 430 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC116553.1-201ENST00000561752 397 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 IKBKE-202ENST00000579827 678 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 LYPD4-202ENST00000601246 1076 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PRKN-210ENST00000612540 603 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 162 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL358215.3-201ENST00000640695 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AOX3P-202ENST00000469595 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 KCNE1-205ENST00000416357 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC005838.1-201ENST00000430712 233 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 VDAC1P13-201ENST00000447826 859 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SNCA-208ENST00000505199 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL645949.2-201ENST00000513434 786 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC084064.1-201ENST00000569938 419 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AFMID-210ENST00000589256 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC020909.3-201ENST00000598194 375 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC108002.3-201ENST00000612629 503 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC092471.2-201ENST00000637219 651 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 RRM2P2-201ENST00000436212 652 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL162464.2-201ENST00000557761 526 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ZNF226-212ENST00000588795 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SIGLEC21P-201ENST00000598990 1010 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL353626.2-201ENST00000615372 130 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 TNNT3-216ENST00000641119 941 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 HAND2-204ENST00000621866 1337 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ACTG1P10-201ENST00000428275 1082 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC087163.1-201ENST00000430089 381 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 HUS1-202ENST00000432325 1125 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC131097.4-201ENST00000442867 571 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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