Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BP2P78314 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms