Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PPP1R32-202ENST00000366212 488 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AP001476.2-201ENST00000435738 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AL035250.2-201ENST00000440889 620 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 ACP2-209ENST00000530453 826 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AP000911.1-204ENST00000533091 571 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 MXRA7-205ENST00000588114 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC112236.2-201ENST00000608402 845 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 IFI27-212ENST00000618863 505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC244230.1-201ENST00000623463 498 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 FAM25BP-203ENST00000624613 404 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PLA2G1B-201ENST00000308366 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC111200.1-201ENST00000358778 657 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 RAB13-201ENST00000368575 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC011995.1-201ENST00000437610 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 INO80C-203ENST00000441607 904 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC099541.1-201ENST00000453828 670 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 LINC01524-202ENST00000454600 745 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 OR7E26P-201ENST00000502808 1006 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AP000753.1-201ENST00000542805 573 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 MORF4L1-208ENST00000558746 874 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 IGKV1D-13-201ENST00000611391 376 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 FAM74A7-201ENST00000613652 727 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TTC38-207ENST00000629918 162 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 GPHN-202ENST00000459628 1723 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 MRGPRX1-201ENST00000302797 1190 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC007389.1-202ENST00000377977 1266 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TPI1-202ENST00000396705 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC008940.1-201ENST00000438117 785 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TIMM23B-202ENST00000451577 1152 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC079779.3-227ENST00000591927 860 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC008993.1-201ENST00000632280 776 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC093323.3-201ENST00000632627 949 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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