Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC021755.2-201ENST00000559022 461 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 VAV1-202ENST00000539284 2627 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms