Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC27P30260 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC27P30260 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC27P30260 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC27P30260 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms