Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
EPCAMP16422 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms