Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AC245297.1-201ENST00000313342 933 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 CYP4F60P-201ENST00000439449 549 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AC022483.2-201ENST00000461464 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 LINC02354-202ENST00000548564 573 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 NEK11-213ENST00000511262 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 ACVR1C-202ENST00000335450 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL5P13501 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 CREB5-205ENST00000409603 1944 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 CACNG1-201ENST00000226021 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 PRSS3-203ENST00000379405 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL5P13501 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL5P13501 AC127537.3-201ENST00000566532 749 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL5P13501 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL5P13501 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL5P13501 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL5P13501 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL5P13501 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL5P13501 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL5P13501 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL5P13501 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL5P13501 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL5P13501 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL5P13501 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL5P13501 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL5P13501 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL5P13501 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL5P13501 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL5P13501 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL5P13501 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL5P13501 GNRH2-203ENST00000380346 353 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL5P13501 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL5P13501 APOBEC3H-203ENST00000421988 592 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL5P13501 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL5P13501 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL5P13501 LINC00271-202ENST00000436554 655 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL5P13501 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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