Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SFTPCP11686 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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