Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9Y3F1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 EXTL3-AS1-204ENST00000523789 543 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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