Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC007598.3-201ENST00000623077 1678 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CELF2-AS1-201ENST00000379256 2468 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 DDX11L2-201ENST00000437401 1398 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 ETFBKMT-205ENST00000538463 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SKOR2Q2VWA4 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 LINC00303-201ENST00000367207 1891 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SKOR2Q2VWA4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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