Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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HOXA3O43365 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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HOXA3O43365 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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HOXA3O43365 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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HOXA3O43365 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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HOXA3O43365 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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HOXA3O43365 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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