Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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