Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LINC02348-201ENST00000618724 489 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CEP70-208ENST00000474781 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PAGE4-202ENST00000376141 487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC074085.2-201ENST00000416734 428 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC009237.11-201ENST00000425635 265 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC018892.1-201ENST00000451098 265 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC073465.1-201ENST00000456671 464 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PRSS2-205ENST00000632998 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PRSS2-206ENST00000633969 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC240565.1-201ENST00000624936 1373 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 TGIF2P1-201ENST00000435390 685 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AC010280.2-201ENST00000507733 410 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 LINC02395-202ENST00000547443 724 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AL589843.2-202ENST00000602289 740 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AP000892.2-201ENST00000613535 324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GAPVD1Q14C86 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 RN7SKP245-201ENST00000364025 320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC083873.1-201ENST00000421179 1099 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC018511.1-201ENST00000436608 380 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 OR7E33P-201ENST00000437705 966 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AL663070.1-201ENST00000438210 725 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CHIA-207ENST00000451398 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 LINC01324-202ENST00000497379 838 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC091132.3-201ENST00000579701 470 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 GDPD1-205ENST00000581140 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC138645.1-201ENST00000582765 470 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC007728.3-201ENST00000602304 746 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 RN7SL238P-201ENST00000613832 290 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.139-201ENST00000616096 290 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 RN7SL106P-201ENST00000618104 290 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AL513478.3-201ENST00000641038 1095 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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