Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ACSL1-210ENST00000513317 2469 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TIAM2-206ENST00000456877 3275 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LINC01588-203ENST00000529902 4279 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LINC00319-202ENST00000448049 3507 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL139220.2-207ENST00000434244 2644 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LY9-205ENST00000392203 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ZWILCH-209ENST00000565627 1845 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC008966.1-201ENST00000502171 2367 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NOL10-205ENST00000538384 3418 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC007598.3-201ENST00000623077 1678 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PCGF2-207ENST00000620225 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TAS1R2-201ENST00000375371 2542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TRAF3IP3-202ENST00000367024 2331 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 VPS16-202ENST00000380445 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC133065.6-201ENST00000625054 2378 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RBFOX1-224ENST00000641259 3651 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ETFDH-206ENST00000511912 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AP003355.2-201ENST00000605923 2622 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC012313.5-201ENST00000594816 2517 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SPATA3-AS1-201ENST00000414876 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SLC18A1-205ENST00000440926 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SPTLC1-201ENST00000262554 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC026469.1-201ENST00000621095 3306 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PSEN1-202ENST00000357710 2776 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 IL17REL-202ENST00000389983 3668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ATP2A1-203ENST00000536376 3130 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SNAI1-201ENST00000244050 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TDRD3-201ENST00000196169 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MINDY1-203ENST00000361936 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 HERC6-201ENST00000264346 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ENPP5-201ENST00000230565 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ABRA-201ENST00000311955 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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