Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms