Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 EXTL3-AS1-204ENST00000523789 543 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
RPS29P62273 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms