Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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