Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms