Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC12Q8WUD4 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms