Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 DTX3L-202ENST00000383661 687 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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TCOF1Q13428 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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TCOF1Q13428 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC009133.3-201ENST00000565600 1656 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 LINC02381-202ENST00000635070 1341 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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TCOF1Q13428 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCOF1Q13428 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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