Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGNL1Q0VF96 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGNL1Q0VF96 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CGNL1Q0VF96 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGNL1Q0VF96 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGNL1Q0VF96 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms