Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK8P49336 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms