Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 ETFBKMT-205ENST00000538463 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 RUNX2-AS1-201ENST00000563807 1513 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 TRIM37-202ENST00000393065 3548 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL031714.1-201ENST00000567829 2926 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCAP28676 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL118511.1-201ENST00000439341 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 LINC01471-201ENST00000461398 3079 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCAP28676 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms