Protein–RNA interactions for Protein: S4R3F8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3F8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
S4R3F8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
S4R3F8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
S4R3F8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
S4R3F8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
S4R3F8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms