Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS6KL1Q9Y6S9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS6KL1Q9Y6S9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms