Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX9Q9Y5X1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX9Q9Y5X1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX9Q9Y5X1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms