Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRPRBQ9Y5M8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRPRBQ9Y5M8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms