Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00588Q9Y4M8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00588Q9Y4M8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms