Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIF3AQ9Y496 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIF3AQ9Y496 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms