Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms