Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED5Q9Y3A6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms