Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HIF3AQ9Y2N7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF3AQ9Y2N7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms