Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAN1Q9Y2M0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms