Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK3Q9Y2K2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK3Q9Y2K2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms