Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFSF13BQ9Y275 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFSF13BQ9Y275 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFSF13BQ9Y275 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms