Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NUDCQ9Y266 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUDCQ9Y266 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms