Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP2BQ9UQN3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP2BQ9UQN3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHMP2BQ9UQN3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms