Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SRPK3Q9UPE1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms