Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHA7Q9UN72 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms