Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PADI4Q9UM07 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms