Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ZNRF3Q9ULT6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNRF3Q9ULT6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms