Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RARRES3Q9UL19 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RARRES3Q9UL19 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RARRES3Q9UL19 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RARRES3Q9UL19 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms