Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV3

ACIN1, Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACIN1Q9UKV3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ACIN1Q9UKV3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACIN1Q9UKV3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ACIN1Q9UKV3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms