Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CROTQ9UKG9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROTQ9UKG9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms